Antibiogramme

Qu'est-ce que l'antibiogramme ?

L'antibiogramme est un test microbiologique utilisé pour tester la sensibilité d'un micro-organisme à un ou plusieurs médicaments antimicrobiens.

Principalement utilisé au niveau sanitaire, l'antibiogramme est traditionnellement réalisé sur des échantillons de colonies bactériennes issues d'unités prélevées par écouvillonnage de gorge, urétral, rectal ou vaginal, ou isolées à partir d'échantillons de selles, d'urine ou d'expectorations.

Techniques exécutives et résistance aux antibiotiques

L'antibiogramme est souvent réalisé avec la méthode de diffusion sur gélose, également appelée technique de Kirby-Bauer.

Au cours de la procédure, un échantillon bactérien est prélevé sur les colonies et ensemencé (correctement disposé) sur le milieu approprié, dans lequel sont également distribués des disques imbibés d'antibiotiques à des concentrations connues (dictées par les besoins thérapeutiques).La plaque est ensuite placée dans un incubateur et après une période de temps prédéterminée (par exemple 18 heures à 35°C) une croissance microbienne relativement uniforme peut être appréciée, avec des halos plus ou moins larges autour des disques de papier absorbant.En fonction de la taille de ces zones d'inhibition, la susceptibilité de la bactérie à chaque antibiotique testé est évalué : si le diamètre est grand le microorganisme est sensible au médicament (S), s'il est petit la bactérie a une sensibilité intermédiaire (I ou MS), alors que si elle est négligeable voire absente, l'espèce bactérienne examinée est résistante (R) au médicament. Pour déterminer avec précision la sensibilité bactérienne, le diamètre des zones d'inhibition est mesuré en mm, en comparant les valeurs obtenues avec les valeurs standards de la souche bactérienne.

Comment prévenir la résistance aux antibiotiques

Les antibiotiques ne sont PAS efficaces contre les virus ; les infections virales typiques sont le rhume, la grippe, la laryngite, la bronchite, le croup et la plupart des maux de gorge (pharyngite).
L'utilisation d'antibiotiques lorsqu'ils ne sont pas strictement nécessaires et indiqués par le médecin peut favoriser le phénomène de résistance aux antibiotiques (les bactéries sont « antibiorésistantes » lorsqu'elles ne peuvent pas être tuées par l'antibiotique).
ATTENTION : c'est la bactérie qui résiste à l'antibiotique, PAS l'individu. Par conséquent, même si vous n'avez jamais utilisé d'antibiotiques, vous pouvez développer des infections causées par des bactéries résistantes aux antibiotiques.
Pour prévenir l'apparition d'une résistance aux antibiotiques, il est FONDAMENTAL de compléter le traitement prescrit par le médecin ; même si cela fait du bien, n'arrêtez pas prématurément de prendre des antibiotiques.

Lorsque lors de l'antibiogramme les halos des disques voisins se confondent, les antibiotiques en question sont considérés comme synergiques.

En alternative à la méthode qui vient d'être décrite, l'antibiogramme peut également être réalisé sur milieu liquide, en évaluant - après incubation - la turbidité correspondant aux différents degrés de dilution du médicament (voir ci-dessous).

L'antibiogramme est aujourd'hui devenu un examen incontournable, compte tenu de la diffusion désormais généralisée du phénomène de pharmacorésistance. Choisir le mauvais antibiotique ou recourir à un médicament à large spectre pour éviter cette procédure peut en effet sélectionner des souches bactériennes résistantes à l'action de celui-ci. Dans l'article consacré à ce sujet, nous avons vu comment cette capacité est à l'origine acquise par des mutations spontanées , et par la suite transmis à d'autres bactéries. Ce n'est donc pas un hasard si la découverte et l'utilisation clinique de nombreux antibiotiques sont allées de pair avec l'émergence de bactéries résistantes à leur action.Très souvent, c'est la faute d'un usage inapproprié et exagéré de ces médicaments, par exemple pour traiter des infections virales contre lesquelles elles s'avèrent totalement inutiles (la seule justification possible est de prévenir toute surinfection bactérienne chez les personnes à risque).

Deux paramètres très importants dérivés de l'antibiogramme sont la CMI et le CMB :

• MIC (Minimum Inhibiting Concentration) : est la concentration la plus faible du composé à tester nécessaire pour inhiber la croissance d'un micro-organisme donné.
• MBC (Minimum Bactericide Concentration) : est la concentration la plus faible du composé à tester nécessaire pour provoquer la mort de plus de 99,9 % d'une population microbienne donnée.

Pour évaluer la CMI en milieu solide par antibiogramme, on suppose que l'agent microbien diffuse du disque dans la gélose créant un gradient de concentration ; par conséquent, plus on s'éloigne du disque, plus la concentration du médicament est faible, qui diminue progressivement jusqu'à atteindre la concentration critique (concentration minimale inhibitrice approchée de la CMI). Au-delà de ce point, il y a une croissance confluente, tandis que dans la zone la plus proche du disque, il n'y a pas de croissance.

Dans l'antibiogramme sur milieu liquide, on prépare une série de tubes à essai contenant le milieu de culture et des dilutions graduées (dans le rapport de 2) de l'antibiotique à tester. Dans chacun de ces tubes à essai, une quantité standard des microbes examinés est inoculée ; l'incubation et l'examen de celui-ci suivent. Comme prévu, en présence de turbidité, la croissance bactérienne est visible, tandis qu'une solution qui reste claire dénote une inhibition complète de la croissance microbienne, soulignant l'efficacité optimale du médicament. Dans ce cas, la CMI (concentration minimale inhibitrice) représente la dilution la plus élevée (c'est-à-dire la concentration la plus faible) d'antibiotique capable d'inhiber complètement la croissance du micro-organisme. La MBC (concentration bactéricide minimale) est plutôt établie en faisant croître les échantillons prélevés du milieu liquide dans un milieu solide approprié et en évaluant toute croissance bactérienne. La CMI correspondra donc à la concentration d'antibiotique présente dans le tube à essai dans lequel le médicament est le plus dilué et qui, à l'examen culturel, ne montre aucun signe d'activité bactérienne (voir figure).

Les résultats de l'antibiogramme sont publiés sur un rapport spécifique, qui indique les antibiotiques utilisés et les MMC relatives ; parfois les combinaisons d'antibiotiques qui peuvent être utilisées et le degré de résistance des micro-organismes sont également répertoriés.
Les méthodes traditionnelles de réalisation de l'antibiogramme, très utiles à des fins didactiques, sont en constante évolution. Aujourd'hui, par exemple, des systèmes commerciaux automatisés sont disponibles, tandis que les disques de papier absorbant peuvent être remplacés par des bandelettes contenant des doses incrémentales d'antibiotique, convenablement indiquées sur la bandelette elle-même (E-test pour antibiogramme).