Lorsque le virus infecte l'organisme, on parle de pathogenèse virale ; elle se compose de phases distinctes :
1er stade : entrée du virus dans l'hôte (appareil respiratoire et digestif, sexuellement, par morsure d'anthropode, plaies, etc.) Certaines infections restent localisées au point d'entrée (comme le rhume) et peuvent être plus ou moins symptomatiques.
2ème stade : le virus peut se répliquer au site d'entrée (par exemple en exploitant les cellules de la muqueuse respiratoire).De ce site primaire il peut ensuite se propager par contiguïté aux cellules voisines (par exemple le froid), ou à distance par voie lymphatique et passage dans les ganglions lymphatiques régionaux, d'où il peut migrer dans les vaisseaux et dans la circulation sanguine (on parle de virémie primaire); le virus peut également se répliquer dans l'endothélium vasculaire et se propager de la circulation - où il est incorporé par les lymphocytes et les monocytes - à divers types d'organes (tels que le foie et la rate), donnant une seconde virémie (virémie secondaire) qui se propage par la circulation sanguine vers les organes cibles.
Les voies de transmission de l'infection sont de deux types : horizontales (d'individu à individu) et verticales (de la mère au fœtus).
Les infections horizontalement peuvent être transmises par :
RESPIRATOIRE : le virus est excrété avec les gouttelettes de salive émises lors de la toux et des éternuements ; les exemples sont les virus du rhume, la rougeole et la varicelle.
ORO-FÉCALE : l'infection se fait par voie orale et la libération du virus par les selles ; un exemple classique est donné par les virus de l'hépatite A.
VENUS : se produit par des micro-lacérations de la muqueuse génitale masculine et féminine, telles que l'herpès génital, le virus du papillome, l'hépatite B et les verrues.
PEAU : les ulcérations et écorchures du derme facilitent l'infection, c'est le cas de la verrue et du molluscum contagiosum.
PARENTÉRALE : le virus est présent dans le sang et peut être transmis par seringues ou transfusions de sang infecté, ou par piqûres d'anthropes ou morsures de mammifères ; les exemples incluent le VIH, les virus de l'hépatite B et C, la fièvre jaune, divers types d'encéphalite virale et la rage.
Quant à la voie verticale, une transmission transplacentaire peut survenir, ce qui peut provoquer des maladies ou des malformations fœtales voire des avortements (VIH, rubéole, cytomégalovirus), ou périnatale (l'infection survient lors du passage de l'enfant dans la filière pelvigénitale, comme dans le cas de l'herpès simplex); certaines infections peuvent également être transmises pendant l'allaitement. Voir aussi : infections pendant la grossesse.
Le même virus peut provoquer des lésions différentes selon l'âge et l'état du système immunitaire de l'hôte. Contrairement aux bactéries, les virus ne produisent pas de toxines et peuvent se retrouver dans les aliments suite à une contamination humaine ou animale. La plupart des infections virales d'origine alimentaire sont attribuables aux virus gastro-intestinaux (entérovirus), à ceux de l'hépatite A et aux polivirus (ou virus de la poliomyélite).
ADÉNOVIRUS
Pharyngite, Pneumonie, Diarrhée
CALICIVIRUS
Hépatite E
FLAVIVIRUS
Hépatite C
HÉPADNAVIRUS
Hépatite B
HERPESVIRUS
-Cytomégalovirus
- L'herpès simplex
-Virus d'Epstein-Barr
-Virus de la varicelle-zona
Infections respiratoires
Fièvre vésiculeuse (boutons de fièvre et herpès génital)
Mononucléose infectieuse, lymphome de Burkitt
Varicelle, herpès (St. Anthony's Fire)
ORTHOMYXOVIRUS
- Virus de la grippe
Influence
PARAMYXOVIRUS
-Virus du papillome
Rougeole Oreillons
PAPOVAVIRUS
Verruca vulgaris (poireau)
PICORNAVIRUS
-Rhinovirus
- Entérovirus
-Hépatovirus
Rhume
Poliomyélite
Hépatite A
POXVIRUS
-Variole
Variole
RÉOVIRUS
-Rotavirus
Syndromes gastro-intestinaux
RÉTROVIRUS
sida
RHABDOVIRUS
Colère
TOGAVIRUS
Rubéole
Médicaments antiviraux et défenses de l'organisme
Les virus ne sont pas des bactéries, c'est pourquoi les antibiotiques sont inefficaces contre les infections virales, alors que certains vaccins offrent une bonne protection. Il existe également des médicaments antiviraux, généralement cytotoxiques et donc nocifs pour le virus et la cellule. La recherche d'un principe actif antiviral doit donc reposer sur l'interaction du médicament avec des étapes spécifiques de la réplication virale ; par exemple, il peut agir sur la pénétration cellulaire du virus, sur la réplication de son génome, sur la synthèse des protéines ou sur la sortie de nouveaux virus de la cellule. Les antiviraux les plus courants agissent sur la réplication du génome viral, donc sur les systèmes enzymatiques, comme les polymérases, impliqués dans cette phase ; un exemple est donné par l'acyclovir.
Les cellules du corps humain se défendent contre les virus en libérant des interférons (α, β et γ) produits par les lymphocytes, les macrophages, les monocytes et les cellules Natural Killer.Lorsqu'une cellule est infectée par un virus elle réagit en produisant de l'interféron, une substance qui n'a pas d'action antivirale directe mais induit dans les cellules - saines et infectées - un état antiviral qui les prépare à "l'infection". L'interféron, interagissant avec des récepteurs spécifiques, induit synthèse de protéines particulières grâce à l'activation de gènes silencieux ; une fois activées, ces protéines favorisent en partie la dégradation de l'ARN messager du virus et inhibent en partie la synthèse des protéines virales.
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